Axes thématiques de recherche
Évolution et Écologie chimique et moléculaire
Objectif
Dans les forêts néotropicales hyperdiverses, la diversité est le résultat de processus écologiques et évolutifs qui peuvent atteindre des niveaux de complexité étonnants.
L’axe EECM se concentre sur l’étude de ces processus qui modulent la diversité moléculaire, chimique et des traits, tous participant à la performance des individus dans leur environnement. Le périmètre géographique couvre les Antilles et l’Amazonie.
Les sujets comprennent :
- La compréhension des processus évolutifs tels que la mutation, la structuration des populations, l’adaptation, la diversification, la spéciation et l’introgression,
- La compréhension des interactions biotiques, telles que les mutualismes, la pollinisation, la compétition, et la prédation sur les processus évolutifs,
- L’étude des résultats des processus écologiques et évolutifs en appui à la conservation de la biodiversité.
Activités de recherche
Les travaux que nous avons développés dans ce cadre ont traité :
- des sources de diversité génétique,
- de la structuration des populations et des mécanismes qui engendrent cette structuration
- des performances et capacités adaptatives des populations et des espèces,
- des interactions biotiques et des conséquences de ces interactions sur la performance des espèces, des aspects pratiques et appliquées des résultats des processus évolutifs.
Faits marquants
Les mutations somatiques à basses fréquences sont héritables chez les Angéliques et les Grignons francs.
L'origine et le devenir des nouvelles mutations ont reçu moins d'attention chez les plantes que chez les animaux. Comme chez les animaux, les mutations végétales devraient s'accumuler avec la croissance et le temps et sous l'effet de l'exposition à la lumière ultraviolette.
Cependant, contrairement aux animaux, les organes reproducteurs des plantes se forment tard dans le développement d'un individu, ce qui permet la transmission à la progéniture des mutations accumulées au cours de la croissance.
Nous avons reséquencé l'ADN de différentes branches différentiellement exposées à la lumière du soleil de deux espèces d'arbres tropicaux. Nous avons montré que les nouvelles mutations sont généralement rares dans les tissus végétaux et qu'elles n'imitent pas les schémas de ramification, mais qu'elles peuvent néanmoins être transmises à la descendance.
Nos résultats offrent une perspective sur les mutations héréditaires des plantes et leur rôle essentiel en tant que moteur de l'évolution.
Publication dans PNAS
Sylvain Schmitt, Patrick Heuret, Valérie Troispoux, Mélanie Beraud, Jocelyn Cazal, et al.. Low-frequency somatic mutations are heritable in tropical trees Dicorynia guianensis and Sextonia rubra. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024, 121, ⟨10.1073/pnas.2313312121⟩. ⟨hal-04481461⟩
Communiqués de presse
Articles de divulgation scientifique
Leroy, T., M. Heuertz, N. Tysklind, and S. Schmitt. 2024. “Une nouvelle étude décortique l’origine des mutations génétiques.” Science et vie. March 2, 2024. ► Lire
Heuertz, Myriam, Niklas Tysklind, Sylvain Schmitt, and Thibault Leroy. 2024. “Une nouvelle étude décortique l’origine des mutations génétiques.” The Conversation. 2024. ► Lire
Hagenlocher, Chiara. 2024. “Mutations chez les arbres : quelles conséquences pour l’adaptation ?” Natura Sciences. March 6, 2024. ► Lire
Interview radio
Delbot, Alexandra, and Sylvain Schmitt. 2024. “Les ultraviolets ne guident pas l’évolution des arbres.” France Culture. March 6, 2024. ► Écouter
Chalamet, Timotee, and Niklas Tysklind. 2024. “Les arbres sont-ils des Xmens?” Les arbres sont-ils des Xmens? | Radio Peyi. July 7, 2024. ► Écouter
Quelques projets
[ 2024 - 2026 ] GEYSER
Développer un panel de microsatellites SSRseq (génotypage à haut débit) à partir du génome de référence du bois de rose déjà acquis pour génotyper tous les individus de la plantation de Risquetout afin que celle-ci puisse être intégrée au Centre de Ressources Biologiques de Guyane, géré par le CIRAD.
[ 2023 - 2025 ] Barcodrain
Développements méthodologiques pour l’utilisation de l’ADNe d’eaux de pluies pour le suivi de la biodiversité de la canopée et des sols en milieu tropical.
[ 2022 - 2025 ] FELiPS
L'étude de l'écologie des félins sauvages en Guyane française en combinant les sciences participatives, l'ADN des excréments (sDNA), la génétique des populations et les approches de métabarcoding.
[ 2020 - 2023 ] Treemutation
Les tissus des arbres les plus exposés à la lumière ont-ils un taux de mutation plus élevé ?